Киборг 009 и войны монстров

После освобождения от контроля организации "Чёрный призрак" киборги, ранее восставшие против неё, расселились по разным странам и ведут мирную жизнь. Ситуация меняется, когда в городах появляется существо, напоминающее динозавра. Оно атакует людей и здания с помощью звуковых волн. Доктор Айзек Гилмор приходит к выводу, что за этим стоят "Чёрный призрак". Он начинает собирать киборгов для новой миссии.

Лидером группы становится Джо Симамура, известный как Киборг 009. К ним присоединяется Хелена — девушка, утверждающая, что потеряла родителей в результате атак монстра. Для борьбы с врагом киборги используют подводный самолёт "Дельфин", оснащённый защитой от ультразвука и соответствующим оружием. Команда отправляется на поиски монстра и новой базы "Чёрного призрака".