Манускрипт ниндзя: Новая глава

События разворачиваются через четырнадцать лет после победы над бессмертным воином Гэммой Химуро и разрушения планов Генерала Тьмы. Дзюбэй Кибагами продолжает странствовать по Японии, зарабатывая как наёмник. Во время путешествия он встречает Сигурэ, жрицу местного храма, которая никогда не покидала пределы своей деревни. Группа демонов уничтожает деревню, убивая всех жителей. Дзюбэй становится их главной целью из-за Драконьего Жемчуга — камня неизвестного происхождения. Сигурэ вместе с монахом Дакуаном и молодым вором Цубутэ направляется в деревню Ягю.

Два демонских клана одновременно охотятся за Сигурэ. Дакуан принимает решение вновь обратиться к услугам Дзюбэя, чтобы обеспечить защиту Жрицы Света. Противостояние между наёмником и демоническими силами становится центральным элементом сюжета. Драконий Жемчуг выступает ключевым объектом, вокруг которого разворачивается конфликт. Персонажи сталкиваются с необходимостью преодолеть препятствия и выжить в условиях постоянной угрозы со стороны противников.