Ящик предложений Мэдаки: Сверхлюди

Мэдака Куроками является главой студенческого совета академии Хаконива и считается сильнейшей ученицей в учебном заведении. Она установила ящик для предложений, через который студенты могут круглосуточно оставлять просьбы о помощи. Вместе с членами совета - Зэнкичи Хитоёси, Коки Акунэ и Моганой Кикайдзимой - Мэдака занимается решением различных проблем учащихся. Вопросы могут касаться как сверхъестественных явлений, так и личных трудностей, включая любовные переживания.

Сюжет развивается с появлением новых персонажей и противников. Организация "План Икс" начинает активные действия, направив своего агента Мёри Унзэн, лидера комитета общественной нравственности, для противостояния с Мэдакой. Параллельно председатель Хакама Ширануй продолжает попытки установить контроль над Мэдакой и учениками класса 13. Эти события создают дополнительные линии конфликта в истории.