Низкоквалифицированный ниндзя

После Второй мировой войны в Японии было создано агентство для борьбы с терроризмом и экстремизмом в Тихоокеанском регионе. Организация комплектовалась профессиональными ниндзя. Первоначально агентство действовало только в пределах Японии, но со временем его зона ответственности расширилась до международного уровня, а численность сотрудников достигла двадцати тысяч человек.

Одним из сотрудников агентства стал Куро Кумогакурэ - семнадцатилетний старшеклассник. Он работает в организации на полставки, совмещая эту деятельность с учебой и повседневными делами. Куро стремится стать полноценным участником команды, занимающейся защитой страны от иностранных преступников.