Аркадия моей юности: Бесконечный путь SSX

События разворачиваются после поражения в войне против империи Иллюмидус, которая порабощает и уничтожает обитаемые планеты. Земля полностью перешла под контроль инопланетных захватчиков. Капитан Харлок и его соратники объявлены врагами человечества и изгнаны с планеты. Империя Иллюмидус продолжает преследование — Харлок, Тотиро и Эмеральда получают кодовые номера S-00999, S-00998 и X-00001 соответственно и объявляются в розыск.

Главные герои вынуждены сражаться не только против сил Иллюмидуса, но и против множества людей, желающих получить вознаграждение за их поимку. Несмотря на предательство и охоту, бывшие защитники Земли продолжают свой путь. Их дальнейшие действия и возможность противостоять захватчикам остаются под вопросом, учитывая численное превосходство противников и отсутствие поддержки среди населения.